Visión
Ser un sólido referente regional e internacional en sanidad agropecuaria, servicios cuarentenarios e inocuidad de los alimentos; ágil y eficiente, con credibilidad y confianza en apoyo a los Estados miembros y sus sectores productivos.
Misión
Apoyar a los ministerios o secretarías de Agricultura y Ganadería de los Estados miembros, en los esfuerzos por el desarrollo de sus planes de salud animal, sanidad vegetal, servicios cuarentenarios e inocuidad de los alimentos y así contribuir al desarrollo económico y social de la población, mediante una producción agropecuaria sana, en armonía con el ambiente, facilitando el comercio internacional.

Valores Institucionales:
Excelencia: Cumplir con los deberes de manera óptima.
Honradez: La rectitud y la integridad en el obrar. Quien es honrado se muestra como una persona recta y justa, que se guía por aquello considerado como correcto y adecuado a nivel social.
Integridad: Es hacer lo correcto, por las razones correctas, del modo correcto.
Lealtad: Virtud que se desarrolla en la conciencia y que implica cumplir con un compromiso aun frente a circunstancias cambiantes o adversas.
Respeto: Saber valorar los intereses y necesidades de otro individuo y la colectividad.
Responsabilidad: Virtud de tomar decisiones y desarrollar acciones de manera consciente y de asumir las consecuencias que las mismas tengan y de responder por ellas ante quien corresponda en cada momento.
Solidaridad: Comprometerse con la causa de los demás.
Transparencia: Actuación que muestra la verdad de sus hechos. Ser transparente es ser claro, evidente, no expresarse con ambigüedad que permita la interpretación.